137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1216 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1216  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 427 aa  888    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  56.44 
 
 		 435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  51.04 
 
 		 423 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  51.75 
 
 		 383 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1960  restriction endonuclease S subunit  34.11 
 
 		 413 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.323459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.49 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1087  restriction modification system DNA specificity subunit  34.32 
 
 		 437 aa  199  9e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0762586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  31.29 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  32.95 
 
 		 411 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0446  restriction modification system DNA specificity subunit  41.58 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000807768  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  30.75 
 
 		 417 aa  169  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03150  hypothetical protein  45.51 
 
 		 182 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.223184  hitchhiker  0.0000000000000424002 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3717  restriction modification system DNA specificity subunit  32.96 
 
 		 427 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3549  restriction modification system DNA specificity subunit  35.78 
 
 		 296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02063  type I restriction-modification system, S subunit  42.78 
 
 		 501 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  28.71 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0899  restriction endonuclease S subunit  38.83 
 
 		 396 aa  131  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681459  hitchhiker  0.00000169581 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2724  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.47 
 
 		 409 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  27.94 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  27.94 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2960  restriction modification system DNA specificity subunit  40.1 
 
 		 587 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  28.91 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4264  type I restriction-modification system, S subunit  38.02 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  26.16 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  27.33 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  25.12 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1842  restriction modification system DNA specificity subunit  25.76 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  24.22 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2346  restriction modification system DNA specificity subunit  29.32 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104931  normal  0.0105772 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01116  hypothetical protein  25.98 
 
 		 400 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  27.36 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.2 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4462  restriction modification system DNA specificity subunit  26.09 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  26.92 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3673  restriction modification system DNA specificity subunit  23.23 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.99 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0750  restriction endonuclease S subunit  24.36 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  22.84 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  25.14 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3951  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.62 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3537  putative type I restriction-modification system, S subunit  23.85 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  23.54 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  30.41 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03130  hypothetical protein  23.94 
 
 		 208 aa  69.3  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0551237  hitchhiker  0.00000000000000986658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5244  restriction modification system DNA specificity domain  24.34 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3120  hypothetical protein  30 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.239583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0808  specificity determinant HsdS-like  25.33 
 
 		 363 aa  67  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.361917  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  22.83 
 
 		 417 aa  67  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2471  type I restriction-modification system S subunit  23.97 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0091078  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0841  type I restriction-modification system, S subunit  22.28 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0789  type I restriction-modification system, S subunit  22.28 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190219  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1914  restriction modification system DNA specificity domain  21.79 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381757 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  28.05 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  22.93 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3352  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  27.57 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000513186  normal  0.0100815 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0556  type I restriction enzyme, specificity subunit  31.77 
 
 		 183 aa  62.4  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239636  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0901  restriction endonuclease S subunit  22.12 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000124976  hitchhiker  0.000000573897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0160  restriction modification system DNA specificity subunit  25.73 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  22.99 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  24.22 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  25.58 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.28 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2852  restriction endonuclease S subunits-like protein  23.88 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  30.67 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  23.33 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0006  type I restriction-modification system, S subunit, EcoA family  23.19 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0198  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.29 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.719886  decreased coverage  0.000218103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  23.89 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1859  restriction modification system DNA specificity subunit  25.24 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.777891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1894  restriction modification system DNA specificity subunit  25.24 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.850685  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  25.52 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  23.36 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  39.74 
 
 		 378 aa  57  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  21.01 
 
 		 446 aa  57  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  21.95 
 
 		 435 aa  57  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  24.64 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  25.28 
 
 		 436 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3351  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  26.83 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00146581  normal  0.0102246 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  25.27 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  24.08 
 
 		 438 aa  55.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3953  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.64 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.11 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1890  type I restriction-modification system, S subunit  37 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  32 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  33.33 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  23.01 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.3 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1566  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 		 403 aa  53.5  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293394  unclonable  0.0000192379 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0098  restriction endonuclease S subunits  23.13 
 
 		 315 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.15 
 
 		 388 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  22.7 
 
 		 422 aa  53.5  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4007  restriction endonuclease S subunits-like  23.61 
 
 		 412 aa  53.1  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.05 
 
 		 457 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 775 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  24.36 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  23.76 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  26.24 
 
 		 456 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  21.97 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  29.73 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  24.39 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>