29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0556 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0556  type I restriction enzyme, specificity subunit  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239636  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0554  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  269  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0203297  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  40.98 
 
 		 417 aa  127  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  39.89 
 
 		 401 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  40 
 
 		 400 aa  121  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  42.48 
 
 		 407 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  33.53 
 
 		 432 aa  98.2  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22810  hypothetical protein  29.17 
 
 		 418 aa  78.6  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  29.88 
 
 		 436 aa  77.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  29.63 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1960  restriction endonuclease S subunit  30.53 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.323459  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  32.82 
 
 		 435 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  27.66 
 
 		 403 aa  65.1  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03130  hypothetical protein  27.27 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0551237  hitchhiker  0.00000000000000986658 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  27.66 
 
 		 403 aa  65.1  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  26.22 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1216  restriction modification system DNA specificity subunit  31.77 
 
 		 427 aa  62.4  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1914  restriction modification system DNA specificity domain  26.87 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381757 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2724  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.18 
 
 		 409 aa  54.3  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03180  hypothetical protein  31.93 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000950219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.54 
 
 		 441 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  27.27 
 
 		 423 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2471  type I restriction-modification system S subunit  26.67 
 
 		 381 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0091078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1894  restriction modification system DNA specificity subunit  25.76 
 
 		 409 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.850685  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1859  restriction modification system DNA specificity subunit  25.76 
 
 		 409 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.777891  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1366  putative type I site-specific restriction-modification system, S subunit  25.97 
 
 		 422 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0493853  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  26.85 
 
 		 383 aa  42.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  23.98 
 
 		 407 aa  42  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  30.1 
 
 		 430 aa  41.6  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>