72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3951 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3951  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 		 406 aa  830    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3537  putative type I restriction-modification system, S subunit  44.66 
 
 		 419 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0446  restriction modification system DNA specificity subunit  34.36 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000807768  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5244  restriction modification system DNA specificity domain  34.4 
 
 		 422 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  39.15 
 
 		 385 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2724  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.72 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3953  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.49 
 
 		 413 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2852  restriction endonuclease S subunits-like protein  32.06 
 
 		 412 aa  116  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01116  hypothetical protein  28.57 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1960  restriction endonuclease S subunit  27.44 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.323459  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3673  restriction modification system DNA specificity subunit  28.46 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  26.4 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4462  restriction modification system DNA specificity subunit  26.52 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  24.69 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  26.16 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0750  restriction endonuclease S subunit  26.68 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1914  restriction modification system DNA specificity domain  26.13 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  25.53 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  30.29 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3717  restriction modification system DNA specificity subunit  26.76 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  24.92 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  26.11 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1216  restriction modification system DNA specificity subunit  24.62 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1087  restriction modification system DNA specificity subunit  25.56 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0762586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3549  restriction modification system DNA specificity subunit  25.28 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0272  type I restriction endonuclease S subunit  39.58 
 
 		 126 aa  67  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0429  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.36 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  22.13 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.14 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  19.86 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  26.2 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  26.2 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  22.98 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  25.07 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  23.61 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  21.25 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.71 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  23.37 
 
 		 477 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  21.43 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  21.43 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.82 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4622  Restriction endonuclease S subunits-like protein  24.44 
 
 		 411 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.156513 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03130  hypothetical protein  41.27 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0551237  hitchhiker  0.00000000000000986658 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1894  restriction modification system DNA specificity subunit  26.48 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.850685  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  19.35 
 
 		 442 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1859  restriction modification system DNA specificity subunit  26.48 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.777891  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  25.34 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  22.04 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  20.2 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  25.53 
 
 		 456 aa  47  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3768  restriction modification system DNA specificity subunit  30.23 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1842  restriction modification system DNA specificity subunit  22.86 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  23.1 
 
 		 374 aa  46.6  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  21.64 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03150  hypothetical protein  30.85 
 
 		 182 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.223184  hitchhiker  0.0000000000000424002 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  24.56 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.35 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  23.13 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  23.13 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  34.21 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  20.27 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  25.81 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0006  type I restriction-modification system, S subunit, EcoA family  23.51 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2423  restriction modification system DNA specificity subunit  26.97 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0035  hypothetical protein  29.2 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  25.93 
 
 		 430 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3440  N-6 DNA methylase  26.2 
 
 		 629 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000836739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  21.99 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.66 
 
 		 456 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1890  type I restriction-modification system, S subunit  30.86 
 
 		 416 aa  43.5  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.08 
 
 		 422 aa  43.1  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>