131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0796 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  100 
 
 
441 aa  895    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  31.88 
 
 
413 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.53 
 
 
453 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  30.32 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  31.29 
 
 
477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  28.54 
 
 
438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  28.82 
 
 
429 aa  173  5.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.96 
 
 
441 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  27.66 
 
 
457 aa  169  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  27.69 
 
 
436 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  26.75 
 
 
456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.5 
 
 
456 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  29.83 
 
 
448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  29.41 
 
 
487 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  29.26 
 
 
439 aa  163  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  28.76 
 
 
443 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  28.83 
 
 
422 aa  157  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  28.22 
 
 
425 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  29.82 
 
 
432 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  27.25 
 
 
461 aa  154  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  29.26 
 
 
431 aa  152  8e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  26.19 
 
 
453 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.99 
 
 
445 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  28.44 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  27.19 
 
 
462 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  26.59 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  26.41 
 
 
415 aa  140  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  27.81 
 
 
437 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  27.62 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  30.11 
 
 
458 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  24.44 
 
 
463 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  29.35 
 
 
448 aa  136  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  25.88 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  25.98 
 
 
444 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  25.1 
 
 
451 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  25.49 
 
 
474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  27.04 
 
 
419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  26.71 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  32.31 
 
 
428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  25.83 
 
 
474 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  28.19 
 
 
407 aa  127  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  23.28 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1366  putative type I site-specific restriction-modification system, S subunit  25.39 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0493853  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  24.53 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0500  restriction modification system DNA specificity subunit  24.55 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.565018  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.74 
 
 
462 aa  110  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  29.24 
 
 
429 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  26.85 
 
 
429 aa  106  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.92 
 
 
427 aa  100  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  21.76 
 
 
416 aa  100  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.68 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  30.56 
 
 
267 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.62 
 
 
473 aa  85.1  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  23.59 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  23.71 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0901  restriction endonuclease S subunit  27.85 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000124976  hitchhiker  0.000000573897 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  22.37 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02063  type I restriction-modification system, S subunit  26.92 
 
 
501 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  23.45 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  27.65 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4264  type I restriction-modification system, S subunit  27.94 
 
 
495 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0162  restriction modification system DNA specificity subunit  36.03 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  28.09 
 
 
511 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2960  restriction modification system DNA specificity subunit  29.32 
 
 
587 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  21.85 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4917  restriction modification system DNA specificity subunit  22.79 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.544675 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  29.5 
 
 
428 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  20.78 
 
 
439 aa  63.9  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  23.62 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.84 
 
 
428 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  21.67 
 
 
290 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0899  restriction endonuclease S subunit  26.11 
 
 
396 aa  57.8  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681459  hitchhiker  0.00000169581 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1093  restriction modification system DNA specificity subunit  21.91 
 
 
394 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.85 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  23.2 
 
 
429 aa  57.4  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  22.83 
 
 
430 aa  57  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.08 
 
 
477 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22810  hypothetical protein  23.93 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0854  restriction modification system DNA specificity subunit  35.82 
 
 
595 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221182  normal  0.0643125 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  23.21 
 
 
433 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0262  type I restriction-modification system specificity determinant  22.71 
 
 
360 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.874092  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  25.67 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4455  restriction modification system DNA specificity subunit  22.64 
 
 
388 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  22.39 
 
 
427 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  23.04 
 
 
429 aa  54.7  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0227  restriction modification system DNA specificity domain  22.6 
 
 
395 aa  53.9  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1957  restriction endonuclease S subunit  42.65 
 
 
85 aa  53.5  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  21.43 
 
 
417 aa  53.5  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13680  hypothetical protein  25.62 
 
 
354 aa  53.5  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.247083  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.33 
 
 
422 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  23.84 
 
 
438 aa  52.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1204  restriction modification system DNA specificity subunit  29.75 
 
 
547 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340549  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  28.33 
 
 
432 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  23.71 
 
 
471 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  25.95 
 
 
477 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3499  restriction modification system DNA specificity subunit  21.85 
 
 
405 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.082109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.94 
 
 
457 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  23.73 
 
 
419 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000406123 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  20.38 
 
 
469 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  25.16 
 
 
442 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>