170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0640 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 
447 aa  913    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  35.51 
 
 
457 aa  285  9e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.98 
 
 
445 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  38.73 
 
 
407 aa  232  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  32.47 
 
 
432 aa  173  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  28.29 
 
 
474 aa  160  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  29.01 
 
 
474 aa  157  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  29.53 
 
 
448 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  29.24 
 
 
438 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  28.88 
 
 
422 aa  150  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  26.11 
 
 
456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.51 
 
 
453 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.65 
 
 
441 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 
429 aa  143  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  26.61 
 
 
451 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  27.16 
 
 
487 aa  140  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  26.18 
 
 
462 aa  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  27.06 
 
 
477 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.91 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  24.03 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  26.23 
 
 
429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  26.12 
 
 
441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  30.3 
 
 
446 aa  131  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  25.66 
 
 
461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.75 
 
 
473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  27.27 
 
 
443 aa  126  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  24.61 
 
 
395 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  26.25 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  24.62 
 
 
439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  24.73 
 
 
464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  27.65 
 
 
437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  28.82 
 
 
425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  29.01 
 
 
428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  24.73 
 
 
453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  28.57 
 
 
458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.74 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  27.41 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  26.67 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.47 
 
 
462 aa  113  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1366  putative type I site-specific restriction-modification system, S subunit  27.19 
 
 
422 aa  110  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0493853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  24.3 
 
 
461 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  25.7 
 
 
448 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  27.43 
 
 
436 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  24.73 
 
 
462 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  22.27 
 
 
458 aa  93.6  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  34.17 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  25.23 
 
 
457 aa  91.7  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  24.12 
 
 
463 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0041  restriction-modification enzyme subunit s3b  25.61 
 
 
406 aa  89.7  1e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.370047  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  28.02 
 
 
431 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  28.31 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2852  restriction endonuclease S subunits-like protein  29.23 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  25.23 
 
 
439 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  22.22 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0446  restriction modification system DNA specificity subunit  32.22 
 
 
434 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000807768  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5244  restriction modification system DNA specificity domain  30.23 
 
 
422 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3951  restriction modification system DNA specificity domain protein  25 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  24.94 
 
 
425 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  24.05 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.59 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.29 
 
 
442 aa  76.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  23.14 
 
 
469 aa  76.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  20.4 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  26.07 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  25.16 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3649  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.15 
 
 
464 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3777  restriction endonuclease S subunits-like protein  22.39 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3850  restriction endonuclease S subunits-like protein  22.39 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  24.65 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  25.64 
 
 
477 aa  70.1  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2409  restriction modification system DNA specificity subunit  20.27 
 
 
442 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  23.97 
 
 
267 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  23.33 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.84 
 
 
477 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3537  putative type I restriction-modification system, S subunit  27.27 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22810  hypothetical protein  24.5 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  21.89 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.56 
 
 
442 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  20.15 
 
 
432 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0272  type I restriction endonuclease S subunit  36.08 
 
 
126 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  20.38 
 
 
479 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  27.25 
 
 
425 aa  62.4  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  24.19 
 
 
429 aa  62  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  20.81 
 
 
397 aa  61.6  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.58 
 
 
390 aa  61.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1991  restriction modification system DNA specificity domain  23.48 
 
 
490 aa  60.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120232  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1093  restriction modification system DNA specificity subunit  22.19 
 
 
394 aa  60.1  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.49 
 
 
444 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0804  restriction modification system DNA specificity subunit  22.38 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526121  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  23.28 
 
 
433 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.76 
 
 
413 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0515  type I restriction-modification system (specificity subunit)  22.3 
 
 
263 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2257  restriction endonuclease S subunits-like protein  21.35 
 
 
413 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2272  type I restriction system specificity protein  23.08 
 
 
399 aa  57.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3515  restriction modification system DNA specificity domain  20.55 
 
 
514 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  20.3 
 
 
387 aa  57.4  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2423  restriction modification system DNA specificity subunit  23.47 
 
 
426 aa  57  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57431  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0429  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.26 
 
 
404 aa  57  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  30.53 
 
 
492 aa  56.6  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02063  type I restriction-modification system, S subunit  21.24 
 
 
501 aa  56.6  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>