132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3144 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 		 412 aa  855    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  30.26 
 
 		 397 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0822  restriction modification system DNA specificity subunit  50.35 
 
 		 577 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.92 
 
 		 429 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3757  restriction modification system S subunit  25.71 
 
 		 436 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.386531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  29.38 
 
 		 420 aa  142  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  29.72 
 
 		 432 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  28.21 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  29.88 
 
 		 422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.79 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  28.94 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  28.7 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  23.68 
 
 		 418 aa  126  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  23.68 
 
 		 418 aa  126  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  27.02 
 
 		 383 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4007  restriction endonuclease S subunits-like  27.22 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  27.02 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  26.22 
 
 		 549 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  25.97 
 
 		 440 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  27.52 
 
 		 422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  25.4 
 
 		 438 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  27.25 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  24.11 
 
 		 447 aa  116  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  26.83 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  25.7 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  23.98 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  23.13 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  25.73 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  24.05 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  24.6 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  26.58 
 
 		 415 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3717  restriction modification system DNA specificity subunit  36.04 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  24.5 
 
 		 424 aa  103  7e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1808  restriction modification system DNA specificity subunit  27.51 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300643  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  24 
 
 		 417 aa  99.8  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  22.46 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  22.46 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  26.33 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  24.4 
 
 		 453 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0920  hypothetical protein  34.57 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3382  restriction modification system DNA specificity subunit  23.66 
 
 		 485 aa  97.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  24.09 
 
 		 373 aa  94  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  26.89 
 
 		 411 aa  93.6  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  36.09 
 
 		 479 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.84 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.47 
 
 		 620 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  21.12 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  25.86 
 
 		 285 aa  86.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.3 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2237  restriction modification system DNA specificity subunit  24.02 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1218  restriction modification system DNA specificity subunit  25.29 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.67755  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  23.35 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4611  restriction modification system DNA specificity subunit  29.58 
 
 		 561 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483614  hitchhiker  0.0000795371 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  23.56 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  24.61 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0035  hypothetical protein  23.73 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.25 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1095  hypothetical protein  23.48 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2028  restriction modification system DNA specificity subunit  23.42 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  37.11 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  22.89 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  21.09 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0873  restriction modification system DNA specificity subunit  21.28 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  26.53 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  20.59 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2249  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.6 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  26 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  25.25 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3914  Restriction endonuclease S subunit  22.64 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1452  restriction modification system DNA specificity domain  29.01 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0462219  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1890  type I restriction-modification system, S subunit  21.8 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  23.33 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0333  restriction modification system DNA specificity subunit  23.17 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  18.28 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  21.61 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  24.49 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  22.92 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  22.79 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  21.83 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  21.05 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  24.16 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1144  restriction modification system DNA specificity subunit  23 
 
 		 473 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17660  restriction endonuclease S subunit  21.79 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  21.83 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  26.37 
 
 		 477 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.7 
 
 		 456 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3499  restriction modification system DNA specificity subunit  20.1 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.082109 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0040  restriction-modification enzyme subunit s3a  30 
 
 		 372 aa  53.1  0.000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0522579  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01116  hypothetical protein  24.67 
 
 		 400 aa  53.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3081  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.33 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2508  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  23.3 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.700746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  22.53 
 
 		 456 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0041  restriction-modification enzyme subunit s3b  27.63 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.370047  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.79 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  21.83 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  20.65 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.62 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  19.55 
 
 		 427 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  21.78 
 
 		 395 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.26 
 
 		 457 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>