More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1261 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 1362 aa  2788    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  23.7 
 
 		 492 aa  145  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.64 
 
 		 484 aa  139  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  25.32 
 
 		 486 aa  139  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  25.93 
 
 		 481 aa  134  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  24.71 
 
 		 484 aa  127  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  25.46 
 
 		 494 aa  126  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  24.71 
 
 		 490 aa  126  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  25.34 
 
 		 484 aa  123  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  25.11 
 
 		 484 aa  122  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  23.79 
 
 		 484 aa  120  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  25.86 
 
 		 495 aa  116  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  28.02 
 
 		 493 aa  116  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  23.64 
 
 		 486 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  31.85 
 
 		 816 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  25.77 
 
 		 488 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  27.47 
 
 		 484 aa  115  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  28.57 
 
 		 873 aa  115  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3440  N-6 DNA methylase  24.9 
 
 		 629 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000836739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  25.47 
 
 		 488 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  28.84 
 
 		 534 aa  114  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  27.25 
 
 		 500 aa  112  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  30.88 
 
 		 499 aa  112  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.27 
 
 		 703 aa  111  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  27.87 
 
 		 493 aa  110  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  29.51 
 
 		 492 aa  110  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  27.42 
 
 		 500 aa  110  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  24.03 
 
 		 490 aa  109  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  28.77 
 
 		 908 aa  109  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  29 
 
 		 493 aa  108  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  23.37 
 
 		 477 aa  108  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  24.22 
 
 		 502 aa  108  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  27.98 
 
 		 485 aa  107  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  28.69 
 
 		 489 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  28.53 
 
 		 489 aa  107  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  25.34 
 
 		 489 aa  106  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  23.84 
 
 		 519 aa  106  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  30.51 
 
 		 499 aa  106  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  26.03 
 
 		 489 aa  105  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  27.17 
 
 		 489 aa  105  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  27.17 
 
 		 489 aa  105  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  29.63 
 
 		 808 aa  105  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  26.75 
 
 		 501 aa  105  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  23.64 
 
 		 509 aa  105  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  30.48 
 
 		 860 aa  104  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  26.48 
 
 		 815 aa  104  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  22.92 
 
 		 495 aa  103  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  31.42 
 
 		 571 aa  103  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  27.39 
 
 		 814 aa  103  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  22.77 
 
 		 489 aa  102  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  28.08 
 
 		 494 aa  101  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  25.69 
 
 		 489 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  27.12 
 
 		 508 aa  100  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  27.12 
 
 		 523 aa  100  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0792  N-6 DNA methylase  24.75 
 
 		 621 aa  100  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.869542  hitchhiker  0.0032636 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  27.33 
 
 		 505 aa  99.8  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  26.15 
 
 		 527 aa  100  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  25.31 
 
 		 545 aa  99.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  23.13 
 
 		 479 aa  99  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.3 
 
 		 504 aa  99  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  24.31 
 
 		 506 aa  98.6  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  22.62 
 
 		 489 aa  98.2  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  26.25 
 
 		 574 aa  98.2  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  23.5 
 
 		 775 aa  98.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  27.99 
 
 		 495 aa  97.4  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  22.2 
 
 		 730 aa  96.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  27.27 
 
 		 891 aa  96.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  23.33 
 
 		 484 aa  96.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  25.47 
 
 		 587 aa  96.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  27.74 
 
 		 496 aa  96.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  25.46 
 
 		 846 aa  95.9  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  28.85 
 
 		 492 aa  96.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  25.35 
 
 		 481 aa  95.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  30.52 
 
 		 633 aa  95.9  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  31.15 
 
 		 508 aa  95.5  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  29.77 
 
 		 503 aa  95.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  27.45 
 
 		 508 aa  95.5  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  26.24 
 
 		 489 aa  95.5  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  25.35 
 
 		 481 aa  95.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.66 
 
 		 644 aa  94.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  23.51 
 
 		 517 aa  94.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  24.55 
 
 		 710 aa  94.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.2 
 
 		 508 aa  93.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  26.22 
 
 		 585 aa  94  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  26.12 
 
 		 824 aa  93.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  29.59 
 
 		 708 aa  92.8  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  26.04 
 
 		 513 aa  92.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  29.01 
 
 		 498 aa  92.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  25.77 
 
 		 574 aa  92  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5276  ATPase  28.94 
 
 		 949 aa  92  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.089004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  29.67 
 
 		 505 aa  91.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  27.61 
 
 		 822 aa  90.9  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  29.59 
 
 		 504 aa  90.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  26.69 
 
 		 506 aa  90.1  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0389  N-6 DNA methylase  25.32 
 
 		 818 aa  89.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231606 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  27.8 
 
 		 526 aa  90.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  26.69 
 
 		 569 aa  90.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  29.57 
 
 		 505 aa  89.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  27.78 
 
 		 527 aa  89.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  28.08 
 
 		 499 aa  89  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>