157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0727 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0727  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 		 400 aa  828    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0968972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  40 
 
 		 400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  36.03 
 
 		 425 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  28.19 
 
 		 492 aa  156  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  26.89 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  32.17 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  46.86 
 
 		 420 aa  130  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  30.83 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.71 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1093  restriction modification system DNA specificity subunit  29.62 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  26.94 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2028  restriction modification system DNA specificity subunit  25.72 
 
 		 391 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.17 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  28.98 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  26.02 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  31.03 
 
 		 402 aa  106  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3010  restriction endonuclease S subunits-like protein  28.79 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116402  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  25.62 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.47 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1452  restriction modification system DNA specificity domain  29.62 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0462219  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1037  restriction modification system DNA specificity domain  30.68 
 
 		 364 aa  94.4  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0890662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  29.84 
 
 		 424 aa  94  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0501  restriction modification system DNA specificity subunit  27.23 
 
 		 612 aa  94  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.435558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4714  restriction modification system DNA specificity domain  25.87 
 
 		 380 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0515  type I restriction-modification system (specificity subunit)  27.78 
 
 		 263 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.35 
 
 		 495 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.29 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1433  restriction modification system DNA specificity subunit  23.34 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1526  restriction endonuclease S subunits-like  28.68 
 
 		 386 aa  86.7  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03610  type I site-specific deoxyribonuclease  24.93 
 
 		 360 aa  86.3  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0835  restriction modification system DNA specificity domain  24.21 
 
 		 563 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.835919  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0686  type I restriction-modification system, S subunit, putative  24.21 
 
 		 561 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.840975  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0162  restriction modification system DNA specificity subunit  31.3 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.323401 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4240  Restriction endonuclease S subunits-like protein  24.44 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  21.41 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2652  Restriction endonuclease S subunits-like protein  24.19 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.252104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02063  type I restriction-modification system, S subunit  25.91 
 
 		 501 aa  79.7  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  25.64 
 
 		 775 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  25.81 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4810  putative type I restriction-modification system specificity subunit  26.33 
 
 		 360 aa  76.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0614  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.08 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  23.4 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  23.05 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0804  restriction modification system DNA specificity subunit  25.45 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526121  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  23.3 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  22.72 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2726  restriction modification system DNA specificity subunit  26.22 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  27.25 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  19.9 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0899  restriction endonuclease S subunit  24.42 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681459  hitchhiker  0.00000169581 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  20.99 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  27.43 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0390  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.18 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219621 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  23.47 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  24.74 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.45 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0901  restriction endonuclease S subunit  26.64 
 
 		 363 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000124976  hitchhiker  0.000000573897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0355  restriction modification system DNA specificity subunit  26.15 
 
 		 590 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.19 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1131  restriction modification system DNA specificity subunit  24.45 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  25.24 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  27.91 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3673  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.54 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  26.29 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  21.12 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  24.62 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0198  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.03 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.719886  decreased coverage  0.000218103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.2 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5008  Restriction endonuclease S subunits-like protein  18.65 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.58 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  25.62 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1991  restriction modification system DNA specificity domain  21.21 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120232  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04178  hypothetical protein  28.09 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.695524  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  21.08 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3537  putative type I restriction-modification system, S subunit  24.37 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  23.33 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3599  hypothetical protein  24.38 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.19 
 
 		 423 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3649  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.83 
 
 		 464 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3499  restriction modification system DNA specificity subunit  27.01 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.082109 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  19.18 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  17.34 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  23.68 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  20.77 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.51 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  23.79 
 
 		 438 aa  55.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  22.48 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  21.92 
 
 		 453 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.23 
 
 		 445 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3030  restriction modification system DNA specificity subunit  23.2 
 
 		 564 aa  53.9  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.36 
 
 		 462 aa  53.9  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  20.63 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  23.47 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.25 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1500  restriction modification system DNA specificity domain protein  25 
 
 		 398 aa  53.5  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.100633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  20.05 
 
 		 456 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1144  restriction modification system DNA specificity subunit  22.46 
 
 		 473 aa  53.5  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1201  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.15 
 
 		 572 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  19.76 
 
 		 461 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  23.81 
 
 		 556 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>