101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2698 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 
267 aa  536  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  42.91 
 
 
438 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  31.52 
 
 
458 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.92 
 
 
453 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  31.85 
 
 
422 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  30.8 
 
 
448 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  31.4 
 
 
464 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  34.08 
 
 
477 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  31.64 
 
 
461 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  29.57 
 
 
443 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  24.71 
 
 
436 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  27.49 
 
 
429 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  27.56 
 
 
456 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  27.2 
 
 
431 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.64 
 
 
456 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  24.34 
 
 
419 aa  96.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  27.11 
 
 
487 aa  96.3  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  30.56 
 
 
441 aa  95.5  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  27.14 
 
 
439 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.14 
 
 
406 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  28.06 
 
 
437 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  26.85 
 
 
453 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  28.85 
 
 
457 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  26.59 
 
 
413 aa  89  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  28.02 
 
 
428 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  30.31 
 
 
432 aa  83.2  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  27.27 
 
 
462 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  33.33 
 
 
426 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  33.33 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  28.68 
 
 
415 aa  79.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  24.31 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  24.6 
 
 
474 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  28.74 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  28.35 
 
 
448 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  24 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.48 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.02 
 
 
427 aa  72.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  23.53 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.28 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  23.41 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1576  type I restriction-modification system, S subunit  27.56 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.200835  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  23.97 
 
 
447 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  26.09 
 
 
463 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1037  restriction modification system DNA specificity domain  27.36 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0890662  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  25.88 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  25 
 
 
462 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  23.08 
 
 
458 aa  65.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  24.71 
 
 
462 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  22.44 
 
 
429 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  48.15 
 
 
474 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4821  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  26.92 
 
 
382 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  50.91 
 
 
445 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  25.71 
 
 
432 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  38.68 
 
 
425 aa  63.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  28.65 
 
 
414 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  51.02 
 
 
407 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  26.55 
 
 
429 aa  60.1  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  19.43 
 
 
477 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  27.91 
 
 
556 aa  58.9  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  22.16 
 
 
511 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  29.65 
 
 
528 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.79 
 
 
620 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  45.1 
 
 
395 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  23.92 
 
 
476 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3471  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.33 
 
 
419 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1366  putative type I site-specific restriction-modification system, S subunit  25 
 
 
422 aa  55.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0493853  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  24.43 
 
 
453 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  23.85 
 
 
460 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  24.51 
 
 
451 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  24.42 
 
 
420 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  20.49 
 
 
450 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  29.59 
 
 
415 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  25.64 
 
 
834 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1566  restriction modification system DNA specificity subunit  25.67 
 
 
403 aa  52.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293394  unclonable  0.0000192379 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  22.79 
 
 
400 aa  52.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  22.87 
 
 
416 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  22.96 
 
 
439 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.48 
 
 
565 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  23.44 
 
 
422 aa  49.7  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  28.95 
 
 
1285 aa  48.5  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4455  restriction modification system DNA specificity subunit  24.43 
 
 
388 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.89 
 
 
457 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  30.1 
 
 
457 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  24.45 
 
 
429 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.53 
 
 
413 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  27.16 
 
 
420 aa  45.8  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2496  subunit S of type I restriction-modification system  22.12 
 
 
565 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00268922  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  26.18 
 
 
425 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  24.04 
 
 
435 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.82 
 
 
419 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2960  restriction modification system DNA specificity subunit  18.57 
 
 
587 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  22.56 
 
 
477 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3515  restriction modification system DNA specificity domain  21.92 
 
 
514 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22810  hypothetical protein  19.56 
 
 
418 aa  43.9  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  22.6 
 
 
393 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  25.83 
 
 
426 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  22.15 
 
 
479 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.91 
 
 
423 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  21.62 
 
 
397 aa  42  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  21.86 
 
 
435 aa  42  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>