82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2180 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2180  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 405 aa  835    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3055  restriction modification system DNA specificity subunit  38.95 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.363566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2272  type I restriction system specificity protein  40.18 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0080  restriction modification system DNA specificity subunit  52.91 
 
 		 392 aa  209  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2423  restriction modification system DNA specificity subunit  31.46 
 
 		 426 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1544  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.28 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.16 
 
 		 408 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3471  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.16 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0816  restriction modification system DNA specificity subunit  33.46 
 
 		 267 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  40.78 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1411  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  28.57 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.202691  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1954  restriction modification system DNA specificity subunit  32.12 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  38.71 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4394  restriction modification system DNA specificity subunit  25.17 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.536192  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  25.79 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.45 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  27.06 
 
 		 419 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1106  restriction modification system DNA specificity subunit  50 
 
 		 161 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1851  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  59.38 
 
 		 194 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5859  putative type I restriction-modification system, S subunit  30.69 
 
 		 584 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1281  restriction modification system DNA specificity subunit  32.28 
 
 		 398 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1105  restriction modification system DNA specificity subunit  31.51 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6044  type I restriction-modification system subunit S  32.12 
 
 		 547 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.061065  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1500  restriction modification system DNA specificity domain protein  48.94 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.100633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0501  restriction modification system DNA specificity subunit  30.81 
 
 		 612 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.435558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  31.29 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.41 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  26.7 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  22.81 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1093  restriction modification system DNA specificity subunit  30.43 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  28.03 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0107  type I restriction modification DNA specificity family protein  52.83 
 
 		 85 aa  67.8  0.0000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.517925  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  28.8 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  30.28 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  22.77 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  24.64 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3173  restriction modification system, type I  26.67 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000000252983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  34.55 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0333  restriction modification system DNA specificity subunit  32.33 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0844  restriction endonuclease S subunits-like protein  24.24 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.33 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.21 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000683293 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3425  restriction endonuclease S subunits-like  27.11 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835151  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  22.34 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3673  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.22 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  25.28 
 
 		 511 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3607  restriction modification system, type I  22.31 
 
 		 396 aa  53.9  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.64 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.13 
 
 		 423 aa  53.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0545  hypothetical protein  26.75 
 
 		 701 aa  53.1  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  23.4 
 
 		 846 aa  52.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4880  putative type I restriction-modification system S subunit  24.59 
 
 		 571 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.960431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.63 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2924  restriction endonuclease S subunit  26.74 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  28.57 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  22.96 
 
 		 429 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0920  hypothetical protein  24.84 
 
 		 460 aa  50.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.62 
 
 		 427 aa  49.7  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  29.37 
 
 		 363 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3010  restriction endonuclease S subunits-like protein  26.72 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116402  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1260  restriction modification system DNA specificity subunit  24.39 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 		 616 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3246  hypothetical protein  23.91 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2028  restriction modification system DNA specificity subunit  26.56 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  25.75 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2743  type I restriction-modification system, S subunit, truncation  26.63 
 
 		 175 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.441032  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4821  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  22.46 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1536  restriction modification system DNA specificity domain  28.8 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  20.66 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0515  type I restriction-modification system (specificity subunit)  26.67 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1037  restriction modification system DNA specificity domain  31.03 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0890662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0792  N-6 DNA methylase  21.97 
 
 		 621 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.869542  hitchhiker  0.0032636 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  20.86 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  23.41 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  32.43 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  29.73 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3499  restriction modification system DNA specificity subunit  29.41 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.082109 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3985  restriction modification system DNA specificity subunit  21.77 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  29.01 
 
 		 707 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  22.06 
 
 		 422 aa  43.5  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  17.92 
 
 		 438 aa  43.5  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  35.44 
 
 		 775 aa  42.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>