35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0221 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  224  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  51.96 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  45.36 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  41.57 
 
 		 115 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  40.78 
 
 		 549 aa  87.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2935  DNA polymerase beta subunit  50.55 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  41.94 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1021  nucleotidyltransferase  41.41 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.598559  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  37.89 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0918  putative nucleotidyltransferase  40.4 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  38.2 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2086  DNA polymerase beta subunit  40.66 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.166795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0417  DNA polymerase beta domain protein region  36.73 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07030  nucleotidyltransferase  34.41 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  35.14 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  32.88 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2535  DNA polymerase, beta-like region  30 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000686331  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  38.46 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  27.18 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  26.88 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  26 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  36.62 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  24.49 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  26.42 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  27 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1589  DNA polymerase beta domain protein region  31.43 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1570  DNA polymerase beta domain protein region  35.11 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  23.75 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1223  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0131  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  24.39 
 
 		 108 aa  41.2  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  34.85 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  40.98 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  30.3 
 
 		 106 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>