36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0292 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 108 aa  215  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  96.26 
 
 		 108 aa  204  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  76.42 
 
 		 108 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  60.4 
 
 		 105 aa  128  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  57.84 
 
 		 123 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  53.4 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  52.38 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  51.49 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  52.53 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  47.96 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  45.36 
 
 		 1294 aa  87  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  38.46 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  40.62 
 
 		 105 aa  76.6  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  36.08 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1466  hypothetical protein  62.5 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  34 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  48.51 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  27.62 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  31.37 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  32.43 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  31.96 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  33.02 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  32.22 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  29.81 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  32.22 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  32.18 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  40.43 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  31 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  26.21 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  37.66 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  30.3 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  23.75 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  34.25 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>