49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0763 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 111 aa  217  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  39.8 
 
 		 247 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  44.68 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  38.04 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  32.67 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  27.62 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  32.35 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  27.62 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  28.85 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  27.36 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  29.52 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  28 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  26.53 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  31.73 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  31.68 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  33 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  31 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  30.69 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  33.67 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  26.04 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  33.73 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  29.9 
 
 		 1294 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  26.04 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  34.38 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2025  DNA polymerase beta domain protein region  32.53 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505934  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  34.88 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  30.17 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  32.61 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  25.26 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  32.29 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  30.39 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  34.25 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0417  DNA polymerase beta domain protein region  26.88 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  26.47 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  29.21 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0872  DNA polymerase beta subunit  28.24 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  hitchhiker  0.0000000998415 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  28.42 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  31.18 
 
 		 271 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3539  DNA polymerase, beta-like region  33.85 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418484  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  24.04 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  27.36 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  28.42 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  24.51 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  42.11 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  27.68 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>