55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1105 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 162 aa  323  6e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  62.03 
 
 		 167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  43.28 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  31.4 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  38.6 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  29.6 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  34.91 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  27.35 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  32.2 
 
 		 295 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  37.14 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  31.62 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  35.16 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  35.16 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  29.17 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  36.27 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  37 
 
 		 132 aa  51.2  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  35.45 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0760  DNA polymerase beta subunit  35.42 
 
 		 133 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0261005  normal  0.995846 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  34.69 
 
 		 241 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  31.67 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  32.39 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  34.04 
 
 		 99 aa  49.7  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  34.95 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  36.46 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  24.17 
 
 		 136 aa  48.5  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  32.74 
 
 		 142 aa  48.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  26.32 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  23.81 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 133 aa  47.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  41.03 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  30.28 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  29.6 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  31.31 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  29.71 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  32.67 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  34.26 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  30.61 
 
 		 252 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  31.37 
 
 		 292 aa  44.7  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  30.88 
 
 		 132 aa  45.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  25.76 
 
 		 146 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  28.68 
 
 		 133 aa  43.9  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  31.78 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  28.87 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  37.78 
 
 		 131 aa  42  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1410  paREP11  40.91 
 
 		 172 aa  42  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.345052  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  25.3 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  32.98 
 
 		 132 aa  41.2  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  28.42 
 
 		 111 aa  40.8  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  26.47 
 
 		 131 aa  40.8  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  31.91 
 
 		 135 aa  40.8  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  36.14 
 
 		 132 aa  40.4  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>