48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4418 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 148 aa  300  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  87.41 
 
 		 143 aa  254  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  50.41 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  40.6 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  39.85 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  41.46 
 
 		 144 aa  84.3  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  32.46 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  36.13 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  31.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  31.69 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  27.5 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  30.65 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  28.47 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  34.82 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  31.06 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  31.4 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  28.79 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  28.79 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  31.9 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  28.89 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  37.21 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  33.73 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  30.69 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  32.2 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  35.14 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  29.13 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  34.88 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  32.2 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  36.05 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  27.78 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  28.99 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  30.95 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  24.83 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  29.6 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  31.52 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  27.56 
 
 		 295 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  25 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  24.04 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  25.76 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  30.08 
 
 		 137 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  24.32 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  28.24 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  30.83 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  28.42 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  29.06 
 
 		 139 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>