57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0766 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 139 aa  278  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  89.21 
 
 		 139 aa  249  9.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  83.33 
 
 		 132 aa  220  6e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  69.47 
 
 		 134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  55.81 
 
 		 131 aa  149  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  57.26 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  53.79 
 
 		 133 aa  139  9e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  44.53 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  38.1 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0755  DNA polymerase beta subunit  43.53 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  38.96 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  41.79 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  40.7 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  39.29 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  34.57 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  43.02 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  37.21 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  43.48 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  32.18 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  29.6 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  44.78 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  35.14 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  31.11 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  32.35 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  35.14 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0217  hypothetical protein  25.93 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  37.21 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  35.14 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  34.75 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  26.77 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  32.09 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  29.6 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  32.1 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  43.1 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  32.09 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  30.85 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  43.08 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  32.53 
 
 		 271 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1438  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 129 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000026658  hitchhiker  0.0000058254 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 189 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  34.33 
 
 		 112 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  35.16 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  38.36 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.18 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  27.38 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1277  DNA polymerase beta subunit  31 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.288341  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0282  DNA polymerase beta subunit  34.38 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  41.27 
 
 		 269 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  32.53 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  30.14 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  30.14 
 
 		 131 aa  40  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  36.76 
 
 		 129 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>