83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1672 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 146 aa  291  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  48.95 
 
 		 146 aa  133  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  36.75 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  38.06 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  33.8 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  39.32 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  37.29 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  33.82 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  35.04 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  32.61 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  35.14 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  29.01 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  41.3 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  31.97 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  30.91 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  33.63 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  29.55 
 
 		 292 aa  58.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  31.67 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  30.66 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  33.94 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  31.86 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  30.66 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  37.63 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  34.21 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  37.33 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  32.32 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  30.1 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1438  DNA polymerase beta subunit  31.68 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000026658  hitchhiker  0.0000058254 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  32.18 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  34.44 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  25.71 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  32.18 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  31.86 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  30.83 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  26.13 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  36.05 
 
 		 241 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  31.73 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  34.74 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1277  DNA polymerase beta subunit  30.69 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.288341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  30.28 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  29.46 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  29.7 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  25.4 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  23.01 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  24.82 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  35.37 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0943  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  24.83 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  32.95 
 
 		 260 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  30.3 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  31.07 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  27.64 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  29.79 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  25.49 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  29.41 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1692  DNA polymerase beta subunit  29 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000104871  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  28 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  24.82 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3028  hypothetical protein  42.31 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0421336  normal  0.501717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1200  DNA polymerase beta subunit  32.95 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  28.92 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  61.29 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  35.9 
 
 		 143 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  29.17 
 
 		 134 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  27.36 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0320  DNA polymerase beta subunit  27.45 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  28.72 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  30.3 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  26.6 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1064  hypothetical protein  46.81 
 
 		 53 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  34.12 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  29.13 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  30.21 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  30.99 
 
 		 93 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  34.44 
 
 		 98 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  31.94 
 
 		 128 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>