16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0943 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0943  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 136 aa  269  1e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1600  hypothetical protein  65.15 
 
 		 132 aa  180  7e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0474  hypothetical protein  48.84 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.763339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0323  hypothetical protein  43.08 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1533  hypothetical protein  40.3 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.959359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0556  hypothetical protein  40.3 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0112545  hitchhiker  0.00000236573 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1093  hypothetical protein  34.81 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  34.23 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  38.46 
 
 		 271 aa  47.4  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 241 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  32.43 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1102  hypothetical protein  28.24 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.431617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  29.66 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  35.87 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  27.66 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  35.85 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>