84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1668 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
146 aa  286  6e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  48.95 
 
 
146 aa  133  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  40 
 
 
271 aa  74.3  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  31.43 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  42.34 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  36.52 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  34.15 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  31.78 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  34.51 
 
 
142 aa  66.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  31.15 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  31.53 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1277  DNA polymerase beta subunit  36.19 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.288341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  37.74 
 
 
241 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  29.2 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  29.66 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  34.09 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  34.09 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  28.93 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1692  DNA polymerase beta subunit  30.1 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000104871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  31 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  27.74 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  29.13 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  32.52 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  34.45 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  28.93 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  34.07 
 
 
106 aa  52  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  25.83 
 
 
146 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  29.37 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1410  paREP11  36.21 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.345052  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  27.74 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  29.69 
 
 
292 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  27.27 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  30.93 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0943  DNA polymerase beta subunit  34.23 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31536  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  34.26 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  33 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  31.31 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4099  hypothetical protein  28.97 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.41555  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  27.94 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0320  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1093  hypothetical protein  40.82 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  22.88 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  30.95 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  36.84 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  28.46 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  30.6 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  31.97 
 
 
250 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  36.62 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  31.25 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  26.77 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  29.03 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  28.7 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  26.36 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  41.89 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  38.03 
 
 
99 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  32.08 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  38.2 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.66 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3028  hypothetical protein  46.51 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0421336  normal  0.501717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  34.74 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  28.97 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  34.62 
 
 
96 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  27.62 
 
 
152 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2579  DNA polymerase beta domain protein region  34.04 
 
 
275 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0226181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  32.05 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  34.25 
 
 
101 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  27.54 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1600  hypothetical protein  32.08 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3599  DNA polymerase beta domain protein region  34.52 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000413662  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  31.08 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  24.81 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  38.03 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  33.82 
 
 
217 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  27.68 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  36.49 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  37.76 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  35.53 
 
 
162 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>