150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2714 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 110 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  43.68 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  45.05 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  40.48 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  43.06 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  46.99 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  41.94 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  40.62 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  40.43 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  40.43 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  37.76 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  36.67 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  38.14 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  38.2 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  36.47 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  40.45 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  45.71 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  35.05 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  40.85 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  32.97 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  32.61 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  37.89 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  41.94 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  34.41 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  36.9 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  31.58 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  35.48 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  34.88 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  39.77 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  36.9 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  34.88 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  41.1 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  34.74 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3265  DNA polymerase beta subunit  35.63 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.255152 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  36.05 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  34.09 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1728  hypothetical protein  43.94 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  39.19 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  37.08 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  38.55 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  34.69 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  41.54 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  35.96 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  31.91 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  37.04 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  41.77 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.99 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  39.68 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  34.88 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  34.88 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  33.68 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  35.53 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  38.46 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  31.52 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  33.68 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  34.74 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  34.15 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  34.34 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  36.49 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  40.54 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1518  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 254 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  35.79 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  37.33 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  35.16 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  35.16 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  28.87 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  34.29 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  32.97 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  28.12 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  38.04 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  33.77 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  35.94 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  29.47 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  39.06 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  33.7 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  27.08 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  45.31 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1292  DNA polymerase beta domain protein region  36.08 
 
 		 177 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114397  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0017  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  39.76 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.378069  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0168  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  39.76 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.172039  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>