134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0274 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  231  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  53.77 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  50.5 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  50.5 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  50.5 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  50.5 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  49.02 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  51.58 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  48.08 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  56.18 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  46.46 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  52.17 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  52.17 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  51.52 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  43.93 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  43.93 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  48.42 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  45.26 
 
 		 98 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  43.12 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  46.39 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  42.39 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  46.94 
 
 		 99 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  42.27 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  36.36 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  42.72 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  38.78 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  43.01 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  43.48 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  35.48 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  34.41 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  32.99 
 
 		 270 aa  63.5  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  37.37 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  43.42 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  36.67 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 110 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  38.89 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  33.77 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  41.98 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  37.68 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  55 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  41.18 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  36.47 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  37.5 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  43.08 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1854  nucleotidyltransferase family protein  32.71 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  39.02 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  37.78 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  38.55 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  33.33 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  34.34 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  36.23 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  39.76 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  34.83 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  32.61 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  34.34 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  34.44 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  36.51 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  36.51 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  34.21 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  35.53 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  38.1 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  31.65 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  32.32 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  38.82 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  39.39 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  38.55 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  38.71 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  28.05 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  41.98 
 
 		 109 aa  48.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  39.24 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  34.21 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.49 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  38.36 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  30.49 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  34.85 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  28.75 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  31.46 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  36.9 
 
 		 254 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  32.99 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  35.62 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  33.78 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  34.09 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3265  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.255152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  34.69 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  30.14 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  38.75 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  31.13 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  37.65 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>