95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1934 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 104 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  60.78 
 
 		 129 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  60.58 
 
 		 105 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  57.69 
 
 		 110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  55.77 
 
 		 104 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  53.54 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  53.54 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  56.67 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  53 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  51.58 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  53.54 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  52 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  50.52 
 
 		 98 aa  104  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  46.39 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  45.36 
 
 		 109 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  44.33 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  39.6 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  39.6 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  41.58 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  58.21 
 
 		 86 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  47.57 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  44.9 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  39 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  38 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  36 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  42 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  33.67 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  41.24 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  38.24 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  40.7 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  39.33 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  30.39 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  62.5 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  34 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  33 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  39.33 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  43.33 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  43.1 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  38.38 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  43.33 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  46.88 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  40.3 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  42.86 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  39.39 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  41.03 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  32.56 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  30.95 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1854  nucleotidyltransferase family protein  33.65 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  39.76 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  36.78 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  37.88 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  42.37 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  41.25 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  37.5 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  32.1 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  31.94 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  33.82 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  34.18 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  31.37 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  36.67 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  38.14 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  35.56 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  39.39 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.86 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  34.33 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  34.92 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  31.17 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  33.85 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  37.33 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  32.89 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  36.21 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  33.85 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  35.48 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  36.21 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  34.38 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  31.67 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  28 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  29.55 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 96 aa  40  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  31.82 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 133 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>