170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0845 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 96 aa  187  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  50.55 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  47.78 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  50.67 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  44.16 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  43.3 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  45.45 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  44.74 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  42.39 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  48.15 
 
 		 93 aa  67  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  43.9 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  41.38 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  46.05 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  44.9 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  49.32 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  39.13 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  40.86 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  44.79 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  45.83 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  43.75 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  38.27 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  39.78 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  43.59 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  37.04 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  45.45 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  39.47 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  38.95 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  36.25 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  37.63 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  44.16 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  39.36 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  39.36 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  46.67 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  37.63 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  36.25 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  35.8 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  38.95 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  34.04 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  35.05 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  43.3 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  42.71 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  42.86 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  45.45 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  41.25 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  41.77 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  41.84 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  45.33 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  42.27 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  31.52 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  47.62 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  46.25 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  40.96 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  39.8 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  45.33 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  40.82 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  40.43 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  45.45 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  40.82 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  38.04 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  40.74 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  32.99 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  40.51 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  37.11 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  31.76 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  44 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  34.74 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  48.81 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  40.26 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  34.94 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  46.59 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  45.78 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  50.85 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  38.95 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  41.79 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  42.11 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  39.47 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  37.8 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3265  DNA polymerase beta subunit  40.74 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.255152 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  39.78 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  41.77 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  40.79 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  32.93 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  40.21 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  36.46 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  31.63 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1757  DNA polymerase, beta-like region  37.78 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.511346  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  37.8 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  29.9 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  42.19 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  32.98 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  39.24 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  39.33 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  40.3 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  38.27 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>