152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1075 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 97 aa  191  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  44.9 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  46.25 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  45.26 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  41.76 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  48.75 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  40.66 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  35.79 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  41.11 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  42.5 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  48.05 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  41.77 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  40.21 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  41.33 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  39.29 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  38.95 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  38.95 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  47.44 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  37.78 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0587  DNA polymerase, beta-like region  41.79 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  38.03 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  38.95 
 
 		 100 aa  62  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  35.87 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  41.3 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  35.87 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  41.89 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  45.59 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  36.08 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  35.05 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  36.62 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  36.9 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  39.51 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  32.98 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  31.03 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  41.98 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  37.78 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  37.78 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  35.42 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  37.8 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  35.44 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  37.8 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  32.65 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  35.21 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  37.04 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  37.04 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  37.88 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  28.42 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  35.44 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  33.73 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  34.09 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  34.41 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  37.8 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  34.44 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  40.24 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  40.79 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  32.98 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  38.78 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  33.7 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  33.7 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  39.33 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  35.37 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  40 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  39.29 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  35.44 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  35.8 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  35.37 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  38.57 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  35.62 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  30.23 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  34.33 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  34.67 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  34.18 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  30.21 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  33.7 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  34.78 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  30.86 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1292  DNA polymerase beta domain protein region  42.27 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114397  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  37.31 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  33.67 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  38.1 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  34.65 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>