164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1298 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  192  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  54.17 
 
 		 96 aa  97.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  49.48 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  54.64 
 
 		 97 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  54.64 
 
 		 97 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  52.22 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 98 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  51.04 
 
 		 96 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  48.35 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  51.65 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  48.28 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  46.59 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  48.35 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  43.62 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  42.22 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  42.22 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  44.58 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  42.71 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  44.79 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  42.71 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  48.39 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  45.12 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  45.35 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  44.83 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  42.7 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  39.78 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  42.7 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  42.22 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 152 aa  67  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  43.59 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  40.43 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  38.54 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  41.11 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  39.36 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  40.23 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  38.37 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  38.54 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  39.58 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  37.89 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  38.89 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  39.76 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  49.32 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  42.53 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1221  nucleotidyltransferase domain-containing protein  50 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  47.22 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  37.5 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  41.67 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  38.55 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  42.35 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  38.04 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  40.22 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  36.25 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  40.48 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  40.4 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  37.8 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  38.55 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  50 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  35.23 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  35.96 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  35.48 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  35.16 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  35.16 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  39.51 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  37.65 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  37.21 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  37.33 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  44.78 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  32.93 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  39.02 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  39.13 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  38.96 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  36.47 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  37.84 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  41.1 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  32.58 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  34.78 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  36.49 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  33.75 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  40.48 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  32.53 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  32.58 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  36.49 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  32.91 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  37.8 
 
 		 101 aa  50.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>