124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1968 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  100 
 
 		 99 aa  200  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  47.67 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  36.36 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  42.71 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  42.71 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  39.6 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  41.24 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  43.3 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  32.65 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  35.79 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  38.38 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  36.08 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  39.39 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  31.63 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  41.35 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  34.69 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  37.11 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  38.54 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  35.71 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  39.18 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  33.67 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  33.67 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  35.64 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  31.87 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  36.27 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  43.66 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  37.04 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  36.05 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  36.62 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  31.91 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  29.9 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  34.62 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  37.8 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  39.51 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  33.72 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  34.12 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  36.11 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  37.66 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  41.98 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1854  nucleotidyltransferase family protein  33.71 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  32.94 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  41.03 
 
 		 169 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  30.43 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  36.49 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  37.21 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  36.25 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  37.21 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  39.76 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  35.44 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  36.25 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  40.54 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  34.88 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  33.73 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  35.37 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  34.43 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  35.56 
 
 		 98 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  38.16 
 
 		 97 aa  47.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  32.91 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  31.71 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  34.09 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  39.02 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  31.03 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  33.72 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  35.8 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  35.63 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  34.04 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  35.23 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  40.23 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  36.23 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  37.66 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  36.71 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  42.03 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  34.62 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  35.14 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  35.56 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  26.47 
 
 		 270 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  38.16 
 
 		 100 aa  43.5  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  33.68 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  36.62 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  31.94 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  29.49 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.66 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  32.91 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>