126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2672 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 96 aa  190  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  80.21 
 
 		 96 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  70.83 
 
 		 97 aa  140  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  46.15 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  46.24 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  41.77 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  45.26 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  45.26 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  43.96 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  40.51 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  44.79 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  44.71 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  39.56 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  41.94 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  37.36 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  43.3 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  43.3 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  46.32 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  45.88 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  50.65 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  34.04 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  38.55 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  35.29 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  41.94 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  37.63 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  37.97 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  41.84 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  35.29 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  43.21 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  40.21 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  36.56 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  41.1 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  38.3 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  40.51 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  38.96 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  34.09 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  43.42 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  38.55 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  38.55 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  35.44 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  42.5 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  42.5 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  36.59 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  37.21 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  43.04 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  41.03 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.59 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  34.18 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  41.76 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  35.29 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  29.79 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  36.73 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  39.76 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  36.36 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  32.26 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  30.49 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  37.18 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  35.87 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  39.73 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  39.56 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  44.29 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  31.65 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  44.59 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  31.65 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  33.71 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  39.66 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  34.48 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  31.58 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  38.89 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  40.85 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  36.99 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  40.54 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  32.97 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  35.14 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  43.75 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1221  nucleotidyltransferase domain-containing protein  42.86 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0587  DNA polymerase, beta-like region  44.83 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  23.6 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  35.96 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  30.49 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  38.27 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  37.66 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  38.89 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  33.77 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  35.16 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  36 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  32.26 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  41.1 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>