148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0871 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 99 aa  202  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  53.06 
 
 		 100 aa  105  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  49.47 
 
 		 102 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  50.53 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  48.96 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 116 aa  90.1  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  46.94 
 
 		 112 aa  83.6  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  45.54 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  42.72 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  43 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  43 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  41.41 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  42 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  39.81 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  44.16 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  41.11 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  40.21 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  39.8 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  39.39 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  51.39 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  41.18 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  40.43 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  41.18 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  34.31 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  39.58 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  39.58 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  38.3 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  34.65 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  34.65 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  34.69 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  41.86 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  33 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  38.89 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  39.78 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  37.65 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  39.77 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  34 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  33.67 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  39.42 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  43.21 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  31.68 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  40.22 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  37.8 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  42.5 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  43.82 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  39.08 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  35.05 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  62.79 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  44.44 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  33.33 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  36.78 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  43.62 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  39.29 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  36.05 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  37.18 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  37.84 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  39.29 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  36 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  37.8 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  35.96 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  34.52 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  35.23 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  35.05 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  48.28 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  36.46 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  36.46 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  39.77 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  37.5 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  32.22 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  37.8 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  34.07 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  35.37 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  32.56 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  38.55 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  30.95 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0587  DNA polymerase, beta-like region  45.45 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  43.18 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  37.97 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  31.76 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  34.09 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  28.24 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  31.94 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  30.95 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  34.44 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  30.68 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  35.82 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  39.47 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  33.68 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>