155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0829 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 98 aa  192  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  60.82 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  59.79 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  46.67 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  45.21 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  45.21 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  37.5 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  40.22 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  33.77 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  34.78 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  39.36 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  34.83 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  38.37 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  41.67 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  36.96 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  36.78 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  36.62 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  37.84 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  33.71 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  36.47 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  31.18 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  41.79 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  31.91 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  39.24 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  32.53 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  34.83 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  36.9 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  36.05 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  35.87 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  32.14 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  32.14 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  32.93 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  31.11 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  34.41 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  31.03 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  30 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  34.09 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  30.43 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  27.91 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  28.24 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  37.8 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  30.21 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  29.89 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  38.67 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  38.67 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  32.1 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  35.29 
 
 		 250 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  34.44 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  32.39 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  31.65 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  36.99 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  32.47 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  34.44 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  32.22 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  35.8 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  33.71 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  29.87 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  36.11 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  31.11 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  30.59 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  34.57 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  32.43 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  28.26 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  32.47 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  30.3 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  30.3 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  33.77 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  36.99 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  28.89 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  31.11 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  30.59 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  35.14 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  34.72 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  35.62 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  35.14 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  34.94 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  32.43 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  28.89 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  61.29 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  31.65 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  30.86 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  39.19 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>