98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2495 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 113 aa  224  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  39 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  49.44 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  38.38 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  36.45 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  36.45 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.36 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  46.75 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  41.76 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  46.27 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  40.45 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  32.26 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  46.25 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  42.47 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  42.47 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  36.11 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  34.88 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  34.94 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  29.81 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  44.12 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  34.94 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  38.04 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  37 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  38.03 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  39.29 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  36.73 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  45.31 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  38.96 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1292  DNA polymerase beta domain protein region  46.07 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  36.19 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  38.96 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  37.17 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  40.24 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  45.59 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  40.91 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  32.61 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  30.48 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  42.03 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  32.61 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  35.9 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  37.78 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  36.19 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  32.71 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  35.37 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  37.33 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  40.32 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  40.24 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  29.87 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  36.78 
 
 		 100 aa  48.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  30.99 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  34.72 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  34.83 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  34.72 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  38.27 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  34.25 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3265  DNA polymerase beta subunit  43.08 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.255152 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  31.87 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  37.68 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  37.14 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  39.34 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  37.7 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  37.14 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0587  DNA polymerase, beta-like region  25.68 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  37.14 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  42.03 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  37.31 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  27.91 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 131 aa  42  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  40.68 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  34.21 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  34.78 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 		 96 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  34.67 
 
 		 112 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  40.91 
 
 		 155 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  40.68 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0146  nucleotidyltransferase family protein  39.13 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0363177  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  33.8 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  35.06 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  38.57 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  30.68 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  34.21 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  28.95 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  29.9 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  29.17 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  28.77 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1518  DNA polymerase beta domain protein region  27.27 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  28.95 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  36.59 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>