76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4407 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 112 aa  227  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  98.21 
 
 		 112 aa  223  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  55.45 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  50.46 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  54.55 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  43.93 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  45.36 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  45.36 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  44.76 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  43.81 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  41 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  45.1 
 
 		 113 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  45.1 
 
 		 113 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  42.22 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  43.52 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  39 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  47.06 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  38 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  39.8 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  32.65 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  37.11 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  33.02 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  36.36 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  34.69 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  36.36 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  32.35 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  36.46 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  34.74 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  34.74 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  30.3 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  33 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  31.91 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  47.5 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  34.15 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  37.31 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  28 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  29.17 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.36 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  30.11 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  36.51 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  26.88 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  30.95 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1528  transcriptional regulator, RpiR family  30.95 
 
 		 320 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  29.21 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  31.88 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  27.47 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1854  nucleotidyltransferase family protein  34.86 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  33.75 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  30.88 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  34.48 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  29.17 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  30.91 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  29.63 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 104 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  30.38 
 
 		 109 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  30.56 
 
 		 96 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  31.91 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  35.38 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  30.91 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  30.99 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  29.17 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  29.9 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  28.79 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  34.57 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>