101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4370 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
132 aa  266  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  53.77 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  52.25 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  46.79 
 
 
113 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  46.79 
 
 
113 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  51.35 
 
 
109 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  49.02 
 
 
109 aa  100  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  48.45 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  48.45 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  44.23 
 
 
126 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  46.46 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  41.58 
 
 
104 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  42.16 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  43.56 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 
129 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  40.68 
 
 
115 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  42 
 
 
98 aa  87  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  43.52 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  43.52 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  38.24 
 
 
104 aa  84.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  42.72 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  43 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  45 
 
 
86 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  42.72 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  34.31 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  37.23 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  37.25 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  36.27 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  37.07 
 
 
103 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  35.11 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  35.11 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  27.48 
 
 
270 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  36.45 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  37 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1854  nucleotidyltransferase family protein  38.61 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  32.29 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  40.32 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  32.91 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  32.91 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  34.09 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  36.67 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  32.98 
 
 
101 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  36.71 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  35.87 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  32.84 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  32.95 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  35.37 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  35.37 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  30.95 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  41.94 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  41.94 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  34.92 
 
 
100 aa  47  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  32.58 
 
 
102 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  32.58 
 
 
102 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  31.18 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  30.53 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  31.07 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  34.48 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  28.16 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  34.67 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.91 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
152 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  36.49 
 
 
97 aa  43.9  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  33.78 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  35.14 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  30.14 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  31.08 
 
 
98 aa  42.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  27.93 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  35.48 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  30.23 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  30.59 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  29.79 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  27.27 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  33.85 
 
 
115 aa  42  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  29.27 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  32.81 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  31.11 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  31.11 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  38.89 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  30.12 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  32.84 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  32.84 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  28.42 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  34.21 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  28.72 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  34.33 
 
 
102 aa  40.4  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  31.08 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  36.21 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 
254 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  34.33 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  29.17 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  37.66 
 
 
96 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>