118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1733 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 98 aa  188  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  42.27 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  42.27 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  44.9 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  44.44 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  40.62 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3539  DNA polymerase, beta-like region  41.3 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418484  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  39.74 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0410  DNA polymerase beta domain protein region  48.04 
 
 		 99 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  44.3 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  32.65 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  34.09 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  38.38 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  34.69 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  37.33 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  37.33 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  36.73 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  34.38 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  40.74 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1757  DNA polymerase, beta-like region  36.67 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.511346  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  42.67 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  32.93 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  32.93 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  33.67 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  31.63 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  40.54 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  27.66 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  34.69 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  31.91 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  37.33 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  41.03 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  37.11 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1292  DNA polymerase beta domain protein region  37.76 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  43.59 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  36.49 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  31.87 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  41.56 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  35.48 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  32.53 
 
 		 99 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  32.93 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  30.14 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  37.97 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  33.66 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  34.67 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  38.55 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  32.65 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  33.77 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  33.77 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  26.14 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  39.24 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  37.18 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  35.44 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  34.25 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  37.33 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  37.84 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  38.71 
 
 		 112 aa  48.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  38.67 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  29.67 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  37.31 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  35.44 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  35.21 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  35.48 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  31.34 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  29.67 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  29.07 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  34.78 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  37.68 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  32.88 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  36 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  31.96 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  35.62 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  30.95 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  31.76 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  32.26 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  34.43 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  32.43 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  28.05 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  28.72 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  36 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  35.06 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  28.38 
 
 		 101 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  30.3 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  35.44 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  38.36 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  30.14 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  37.33 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  29.35 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  29.29 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  29.76 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>