113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2704 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  100 
 
 		 95 aa  189  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  47.25 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  45 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  48 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  50.63 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  48.1 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  48.1 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  44.3 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  40.45 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  41.18 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  40.24 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  41.18 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  40.45 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  37.5 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  39.76 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  43.06 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  47.14 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  41.89 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  34.07 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  42.39 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  39.56 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  38.82 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  38.82 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  33.75 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  39.51 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  36.56 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  38.82 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  41.1 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  27.96 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  39.33 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  36.9 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  36.9 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  45.59 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  36.99 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3265  DNA polymerase beta subunit  41.56 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.255152 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  40.45 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  41.46 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  46.38 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  34.52 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  40.3 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  37.65 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  49.23 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  36.25 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  34.21 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  47.14 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  40.23 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  34.83 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  42.25 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  34.88 
 
 		 94 aa  49.7  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  40.45 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  40.96 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  35.63 
 
 		 254 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  38.36 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  35.23 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  36.14 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  31.11 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  36.84 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  48.15 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  40.54 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  35.11 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  37.8 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  38.55 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  39.19 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  42.25 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  37.8 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  34.44 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  32.56 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  40.26 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1757  DNA polymerase, beta-like region  33.68 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.511346  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  61.29 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  42.03 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  30.43 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  44.78 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  34.07 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  37.33 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  39.71 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1292  DNA polymerase beta domain protein region  43.9 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  46.94 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  45.16 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  37.66 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  28.09 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  32.84 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>