176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1527 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 145 aa  280  5.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  45.73 
 
 		 169 aa  98.2  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  43.62 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  51.11 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  46.67 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  48.96 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  45.56 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  47.37 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  40.66 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  45.26 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  47.37 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  44.44 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  46.32 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  47.78 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  46.59 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  42.22 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  42.11 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  45.12 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  37.23 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  41.05 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  40.22 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  41.11 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  45.12 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  41.25 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  45.57 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  45.21 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  38.75 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  40.79 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  34.44 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2046  hypothetical protein  53.7 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  36.26 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  41.76 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  41.98 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  36.26 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  34.48 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  39.77 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  34.78 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  35.53 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  40.23 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  36.78 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  32.61 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  43.08 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1176  putative transcriptional regulator, Nlp  41.54 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.035714  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  42.31 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  46.27 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  38.64 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  45.65 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  42.42 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  35.63 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2002  putative transcriptional regulator, Nlp  42.59 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  38.46 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  43.94 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  40.79 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26330  predicted nucleotidyltransferase  47.92 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155672  normal  0.055633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  40.66 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  45.61 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  39.29 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1512  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  37.11 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0340826  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  29.85 
 
 		 475 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  34.62 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  53.85 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  36.96 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  35.79 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.93 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 284 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 277 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  36.96 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  42.42 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  32 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0017  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  46.32 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.378069  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0168  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  46.32 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.172039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  34.69 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  37.97 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 182 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.15 
 
 		 267 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  34.41 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  35.19 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  41.79 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  37.36 
 
 		 96 aa  43.5  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  39.13 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  36.78 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  45.65 
 
 		 461 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  34.69 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  27.06 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1585  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.772364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  38.03 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>