156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1790 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 114 aa  217  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  77 
 
 		 115 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 98 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  50.55 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  51.09 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  47.25 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  48.42 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  56.52 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  47.37 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  47.37 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  46.88 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  42.11 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  48.28 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  45.36 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  45.56 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  42.53 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  44.71 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  45.88 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  41.94 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  40.23 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  47.3 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  36.79 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  41.18 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  45.45 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  39.33 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  37.11 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  37.35 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  39.76 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  43.53 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  41.77 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  37.78 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  38.64 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  42.67 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  38.89 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1221  nucleotidyltransferase domain-containing protein  50 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  32.94 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  38.71 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  40.91 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  36.62 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  45.21 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  41.89 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  43.24 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  35.85 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  40.26 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  37.84 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  39.47 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  39.44 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  43.08 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  37.65 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  37.33 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  37.66 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4395  hypothetical protein  41.38 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0622266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  39.29 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  34.48 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  37.04 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  35.19 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  41.56 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  37.76 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  32.1 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 254 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  37.33 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  34.21 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  36 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  34.94 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  42.03 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  37.04 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  38.16 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  42.19 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  40.58 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  32.97 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  31.25 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  34.09 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  34.52 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  34.52 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  25.27 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  32.14 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  38.27 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  32.26 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  34.67 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  30.61 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  30.61 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>