140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1203 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 102 aa  207  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  62.89 
 
 		 97 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  64.95 
 
 		 97 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  64.95 
 
 		 97 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  62.64 
 
 		 98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  58.76 
 
 		 97 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  55.32 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  56.84 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  50.54 
 
 		 97 aa  90.5  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  51.06 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  48.96 
 
 		 96 aa  88.2  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  47.92 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  48.42 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  52.22 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  43.02 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  46.15 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  39.58 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  43.01 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  41.18 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  38.46 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  45.98 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  43.43 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  38.54 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  36.9 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  41.11 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  37.62 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  36.89 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  40.21 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  41.94 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  40.62 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  41.94 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  40.43 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  43.53 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  39.77 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  45.33 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  34.65 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  35.48 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  39.22 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  42.35 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  44.44 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  36.14 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  34.15 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  43.59 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  35.11 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  38.61 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  38.61 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  36.27 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  31.68 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  42.47 
 
 		 101 aa  52.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  34.07 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  37.65 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  35.23 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  33.73 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  36.27 
 
 		 254 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  39.74 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  39.74 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  36.49 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  36.84 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  37.89 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  37.66 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  38.03 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  37.23 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  30 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  32.26 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1512  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0340826  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  33.7 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  41.89 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  37.66 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  35.06 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  36.84 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  41.43 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  37.93 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  30.59 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  40 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  31 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  32.35 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  37.18 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  33.7 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  32.56 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  37.66 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  35 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  32.97 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4395  hypothetical protein  43.75 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0622266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  31.87 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  31.07 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  29.03 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  41.18 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>