83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2359 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 100 aa  202  9e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  39.58 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  43.21 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  46.97 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  51.56 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  41.1 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  36.17 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  38.16 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  40.3 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  34.25 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  40.62 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  43.84 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  32.98 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  47.54 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  32.97 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  38.55 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  52.83 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  39.24 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  41.67 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  35.44 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  39.73 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  50 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  35.11 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  36.62 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  37.35 
 
 		 254 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  39.19 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  33.75 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  35.06 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  41.1 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  38.71 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  34.09 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1728  hypothetical protein  36.49 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  38.89 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  43.48 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  30.93 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  31.94 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.71 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  30.56 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  34.15 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  30.53 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  36.71 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  40.32 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  29.47 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  38.03 
 
 		 271 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  40.32 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  45.83 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  36.62 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  32.89 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  38.98 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  36.76 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  28.26 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  35.44 
 
 		 98 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  29.59 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1757  DNA polymerase, beta-like region  34.07 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.511346  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  35.8 
 
 		 97 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  43.06 
 
 		 105 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  30.12 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  36.99 
 
 		 93 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  34.72 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  36.23 
 
 		 97 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  31.82 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  35.8 
 
 		 97 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  42.11 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  36.84 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  34.92 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  41.07 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  36.23 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  36.21 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  28.12 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  38.67 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  31.82 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  37.7 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  38.81 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  32.39 
 
 		 132 aa  40  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  64.29 
 
 		 110 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  30.69 
 
 		 105 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>