35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3062 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 189 aa  378  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  43.21 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 110 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  34.88 
 
 		 137 aa  48.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  34.52 
 
 		 97 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  39.39 
 
 		 97 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  29.35 
 
 		 104 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 98 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  27.35 
 
 		 102 aa  45.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  37.65 
 
 		 105 aa  45.1  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  34.07 
 
 		 118 aa  44.7  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  31.34 
 
 		 132 aa  44.7  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  31.52 
 
 		 98 aa  45.1  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  32.35 
 
 		 115 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  43.4 
 
 		 112 aa  44.7  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 106 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  39.68 
 
 		 115 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  32.89 
 
 		 116 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  38.71 
 
 		 98 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  36.99 
 
 		 142 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 103 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2455  DNA polymerase beta domain protein region  30.85 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.347866  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  33.78 
 
 		 109 aa  42.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  35.29 
 
 		 1294 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  34.48 
 
 		 133 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1728  hypothetical protein  32.91 
 
 		 97 aa  41.6  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  47.5 
 
 		 132 aa  41.6  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 139 aa  41.6  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0015  hypothetical protein  36.67 
 
 		 289 aa  41.6  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  37.04 
 
 		 155 aa  41.6  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  25.41 
 
 		 108 aa  41.2  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  36.71 
 
 		 98 aa  41.2  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>