74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2973 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 132 aa  268  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  47.93 
 
 		 132 aa  120  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  49.17 
 
 		 139 aa  116  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  44.53 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  47.83 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  44.17 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  43.33 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  41.6 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0755  DNA polymerase beta subunit  45.78 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  48.48 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  41.76 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  41.67 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  34.75 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  33.78 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  47.37 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  41.67 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  37.08 
 
 		 271 aa  51.6  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  41.24 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  34.04 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  36.47 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  31.36 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  34.38 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  33.62 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  34.75 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  35.62 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  43.84 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  35.96 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  47.37 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  28.99 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  35.37 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  48.28 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  47.37 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  24.74 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  55.56 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  32.05 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  32.05 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  29.46 
 
 		 1294 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  36.96 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  29.73 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  34.12 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  44.62 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  32.08 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  31.03 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  35.06 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  35.8 
 
 		 131 aa  42.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  43.48 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  44.44 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  45.33 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2738  DNA polymerase beta domain protein region  34.94 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  33.78 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  46.43 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 270 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 112 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  36.11 
 
 		 99 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  34.15 
 
 		 122 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 106 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 151 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  30.89 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  47.5 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  34.15 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  34.69 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  57.89 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  30.67 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  32.43 
 
 		 96 aa  40  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  45.1 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  34.95 
 
 		 140 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  31.94 
 
 		 146 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  35.14 
 
 		 129 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>