74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2195 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
145 aa  291  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  39.16 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  36.96 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  35.65 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  36.63 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  31.4 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  33.93 
 
 
148 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  35.58 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  36.28 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  29.69 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  29.32 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  36.94 
 
 
241 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  33.9 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  31.82 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  33.93 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  34.51 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  35 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  32.23 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  32.41 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  31.62 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  38 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  33.94 
 
 
146 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  31.53 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  32.08 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  33.66 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  30.93 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  31.15 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  34.45 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  35.54 
 
 
123 aa  52.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  32.04 
 
 
146 aa  52.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  30.84 
 
 
144 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0328  hypothetical protein  37.68 
 
 
72 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  31.11 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  34.65 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0172  nucleotidyltransferase  30.63 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  31.15 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  31.07 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0129  DNA polymerase beta domain protein region  27.91 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00283824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  31.09 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  27.19 
 
 
153 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  33.66 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  28.97 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  31.37 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  27.36 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  27.78 
 
 
292 aa  44.7  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  55.56 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3028  hypothetical protein  56.82 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0421336  normal  0.501717 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  23.68 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 
143 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  27.83 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  24.47 
 
 
132 aa  42.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0760  DNA polymerase beta subunit  25.51 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0261005  normal  0.995846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  45.61 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  30 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2738  DNA polymerase beta domain protein region  62.07 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  40.82 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  46.51 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  24.56 
 
 
131 aa  40.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  22.55 
 
 
276 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  22.55 
 
 
295 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  32.35 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1589  DNA polymerase beta domain protein region  54.76 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  30.48 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  31.31 
 
 
247 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0545  DNA polymerase beta subunit  28.46 
 
 
128 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>