43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2563 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 133 aa  270  7e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  99.25 
 
 		 157 aa  266  5.9999999999999995e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  39.85 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  40.48 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  38.14 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  35 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  37.39 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  35.96 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  33.63 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  33.05 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  30 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  30.39 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  32.23 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  29.32 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  30.66 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  34.09 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  32.28 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  32.8 
 
 		 167 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  30.25 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  37.96 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  35.07 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  35.16 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  35.34 
 
 		 271 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  28.28 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0545  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  30.19 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1404  DNA polymerase, beta-like region  32.38 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304011  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  32.09 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  31.4 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  26.61 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  26.56 
 
 		 292 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  30.56 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  29.35 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  22.96 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  31.3 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  31.85 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  25.42 
 
 		 131 aa  40  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  30.43 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  23.85 
 
 		 145 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>