65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0178 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 
163 aa  330  7.000000000000001e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  46.15 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  43.28 
 
 
162 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  42.31 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  41.22 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  36.52 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  33.93 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  37.61 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  39.22 
 
 
241 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  32.26 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  30.83 
 
 
148 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  35.94 
 
 
148 aa  62.4  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 
145 aa  61.2  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  41 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  33.02 
 
 
141 aa  57.4  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  36.27 
 
 
123 aa  57.4  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  32.28 
 
 
133 aa  57.4  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  32.28 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  31.69 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  37.38 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  38.38 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  32.09 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  32.41 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  29.66 
 
 
140 aa  54.3  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  29.6 
 
 
135 aa  53.9  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  30.1 
 
 
292 aa  52.4  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  30.71 
 
 
146 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  33.61 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  34.29 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  33.67 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  38 
 
 
142 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  29.51 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  31.86 
 
 
146 aa  48.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  38.55 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  33.62 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0129  DNA polymerase beta domain protein region  33.61 
 
 
147 aa  47.4  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00283824  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  32.08 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  33.7 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  30.39 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  35.63 
 
 
132 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  31.3 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  30.6 
 
 
131 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  28.87 
 
 
295 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  26.61 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  35.51 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  32.48 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  29.46 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  32.17 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  30.51 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0872  DNA polymerase beta subunit  34.09 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  hitchhiker  0.0000000998415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  27.84 
 
 
252 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  36.08 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  38.2 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  26.8 
 
 
276 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  37.1 
 
 
105 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1589  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 
96 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0172  nucleotidyltransferase  28.85 
 
 
109 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  46.15 
 
 
110 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  31.82 
 
 
131 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  28.97 
 
 
143 aa  41.2  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  27.78 
 
 
131 aa  40.8  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  30.49 
 
 
145 aa  40.8  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  31.65 
 
 
124 aa  40.8  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3044  hypothetical protein  28.74 
 
 
129 aa  40.8  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4099  hypothetical protein  32.35 
 
 
129 aa  40.8  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.41555  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>