36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4507 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 103 aa  204  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0872  DNA polymerase beta subunit  65.22 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  hitchhiker  0.0000000998415 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  35.11 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  37.21 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  33.73 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  33.72 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  32.56 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  31.76 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  31.4 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  32.29 
 
 		 247 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  42.31 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  34.12 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  30.43 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  32.58 
 
 		 1294 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1570  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  37.18 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  31.18 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  28.74 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  33.7 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  24.72 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  26.97 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  31.46 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  28 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  32.94 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  28.09 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 96 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  22.34 
 
 		 100 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4093  DNA polymerase beta subunit  35.87 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.792908  normal  0.694143 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  30.53 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  24.72 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  32.14 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  32.89 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  35.37 
 
 		 189 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>