39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0233 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 108 aa  216  7.999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  96.26 
 
 		 108 aa  204  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  75.47 
 
 		 108 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  61.39 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  59.8 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  54.29 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  52.43 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  55.56 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  52.48 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  50 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  46.39 
 
 		 1294 aa  90.1  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  42.71 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  40.4 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  37.11 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  35 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1466  hypothetical protein  60.94 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  34.23 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  49.5 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  27.62 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  34.44 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  31.96 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  30.39 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  34.29 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  30.39 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  32.22 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  26.92 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  26.26 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  32.32 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  32.18 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  38.96 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  24.49 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  30.3 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  35.62 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  30.53 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  27.52 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>