36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1691 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 95 aa  192  9e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  47.73 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  38.2 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  45.98 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  38.2 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  39.77 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  36.96 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  38.2 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  39.33 
 
 		 103 aa  66.6  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  34.44 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  41.86 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  43.18 
 
 		 1294 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  41.76 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  31.82 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  36.96 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  39.51 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  30.95 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  37.08 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  39.47 
 
 		 247 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  34.21 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  27.71 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  43.94 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  46.43 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1589  DNA polymerase beta domain protein region  37.84 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  44.62 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  38.3 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  34.31 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  28.74 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>