36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0754 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 106 aa  213  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  94.34 
 
 		 106 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  38.38 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  40.38 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  41.58 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  42.86 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  39.39 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  37.25 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  33.96 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  35.92 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  31.37 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  34.62 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  35.87 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  35.11 
 
 		 103 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  35.92 
 
 		 1294 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  31.73 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  34.34 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  39.51 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  34.31 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  33.68 
 
 		 247 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  36.67 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  32.47 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  28.28 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  30.61 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  28.71 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0872  DNA polymerase beta subunit  36.59 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  hitchhiker  0.0000000998415 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  35.63 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  32.67 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2319  DNA polymerase, beta-like region  36.84 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000830496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  28.28 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  32.32 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  35.11 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>