51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0284 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 99 aa  204  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  96.91 
 
 		 98 aa  193  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  70.1 
 
 		 97 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2025  DNA polymerase beta domain protein region  64.56 
 
 		 82 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505934  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  39.39 
 
 		 247 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0302  hypothetical protein  93.33 
 
 		 31 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  41.03 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2977  hypothetical protein  93.33 
 
 		 31 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  30.69 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  33 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1936  putative nucleotidyltransferase  39.53 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  30.69 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  31.68 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  29.13 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  29.81 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  32.65 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  30.61 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  37.33 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  29.03 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  30.53 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  26.42 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  34.15 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  34.48 
 
 		 118 aa  47.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  27.84 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  37.5 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  33.75 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  31 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  28.43 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  37.08 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  32.56 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  29.49 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  28.71 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  28.71 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  32 
 
 		 1294 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1130  hypothetical protein  35 
 
 		 269 aa  43.5  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485024  decreased coverage  0.0063751 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  36.71 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  29.67 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  32.05 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  26.67 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  30.95 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  26.17 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  25.88 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  26.73 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0129  DNA polymerase beta domain protein region  32.53 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00283824  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  31.17 
 
 		 96 aa  40  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  32.89 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>