70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1920 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 116 aa  234  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  76.42 
 
 		 116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  67.54 
 
 		 116 aa  154  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  45.28 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  43.93 
 
 		 111 aa  84.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1020  DNA polymerase beta subunit  47.96 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  41.94 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  29.9 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0236  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  38.54 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  39.29 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  43.75 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  36.08 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  37.84 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  32.69 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  36.54 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  36.27 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  36.27 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1681  DNA polymerase, beta-like region  33.01 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.044025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  41.67 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  37.04 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  35.58 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  32.26 
 
 		 191 aa  52  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0997  DNA polymerase beta subunit  35.64 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3962  DNA polymerase beta domain protein region  41.25 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  33.33 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  36 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  31.07 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  36.26 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  32.38 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4091  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  35.53 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  36.26 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1301  DNA polymerase beta subunit  34.86 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.452159 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  32.95 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  41.03 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  31.07 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  34.38 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  32.94 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  45.61 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  36.78 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0499  nucleotidyltransferase domain-containing protein  34.94 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  32.38 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  32.38 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  32.38 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  30.21 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  32.69 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  28.74 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  54.76 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  32.65 
 
 		 111 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  29.81 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  31.68 
 
 		 102 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  57.14 
 
 		 104 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1089  DNA polymerase beta subunit  51.35 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.947057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  36.59 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  51.35 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4901  DNA polymerase, beta-like region  60 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  26.73 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  31.76 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  34.38 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1347  DNA polymerase beta subunit  48.84 
 
 		 125 aa  40.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.103374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  45.83 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0596  DNA polymerase beta domain protein region  62.96 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0115055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  30.34 
 
 		 114 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 130 aa  40  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>