86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2244 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 
146 aa  290  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  32.84 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  40.57 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 
148 aa  76.6  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  34.19 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  36.52 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  34.78 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  34.97 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  33.67 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  29.6 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  32.61 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  35.96 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  34.29 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  39.25 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  32.46 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  33.04 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  31.43 
 
 
132 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  32.73 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  39.62 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  33.59 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  31.78 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  30.37 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  32.31 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  31.86 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  30.48 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  33.9 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  32.14 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  39.09 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  33.03 
 
 
292 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  28.78 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  29.25 
 
 
241 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  32.73 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  29.46 
 
 
132 aa  58.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  36.04 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  31.07 
 
 
271 aa  57  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  29.06 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  29.31 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3749  hypothetical protein  26.09 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  30.91 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 
152 aa  52  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4484  DNA polymerase beta domain protein region  29.09 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0217  hypothetical protein  27.83 
 
 
141 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  30.71 
 
 
163 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  24.58 
 
 
137 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  26.05 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  34.41 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  38.2 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  32.11 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  29.03 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  28.21 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  29.35 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  31.96 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4099  hypothetical protein  24.07 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.41555  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  29.6 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  29.6 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  29.1 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  29.75 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  23.62 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  23.81 
 
 
162 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 
132 aa  47.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  28.3 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  32.97 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  30.4 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  27.62 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  28.23 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  25.51 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  23.68 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  31.46 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  31.87 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0755  DNA polymerase beta subunit  35.9 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  25.53 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1312  hypothetical protein  25.87 
 
 
198 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  24.71 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  32.26 
 
 
102 aa  41.2  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1064  hypothetical protein  41.67 
 
 
53 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1410  paREP11  30.61 
 
 
172 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.345052  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0172  nucleotidyltransferase  25.74 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  35.44 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  31.03 
 
 
102 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  32.39 
 
 
98 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  31.94 
 
 
132 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>